该校区与中心校区实行同步管理，备课、教研、考试、分析、评价全流程一体化，师资团队由中心校区骨干教师与全国优秀教师共同组成，保障教育质量。
今年深大附中盐田校区将借址深大附中前海校区（南山区前海路0353号）先行办学，首届预计招生330人、开设6个教学班，预计一年后搬回盐田永久校区。
盐田校区位于盐田区盐田街道青云路，总投资近6亿元，建筑面积超7万平米，规划42个教学班、2100个优质公办学位。不同于常规分校合作模式，该校区与深大附中中心校区、前海校区为同一法人主体，真正实现一体化办学、同标准管理。

作为深大附中首个高中分校,盐田校区的师资不是"另起炉灶",而是从中心校区直接输出强大团队:核心管理团队(筹备组长:正高、特级教师,有创办新校经历)、学科带头人、备课组长均由中心校区选派骨干担任。同时面向全国招聘优秀教师、骨干教师,实行"双校区教师轮动机制“中心校区名师定期到盐田校区授课、带教,盐田校区青年教师到中心校区跟岗研修。此外,学校还依托深圳大学,引入高校教授担任"学术导师",让高中生提前感受大学思维。